Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SRSF4Q08170 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms