Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARDQ03181 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms