Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms