Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFC1P60507 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms