Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA9P57773 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms