Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S2P56377 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms