Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HK3P52790 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HK3P52790 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HK3P52790 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms