Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms