Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC1A2P43004 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms