Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPARGP37231 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms