Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TGFBR1P36897 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms