Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBSP35520 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBSP35520 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms