Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTGER1P34995 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTGER1P34995 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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