Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms