Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCAP28676 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCAP28676 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCAP28676 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCAP28676 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms