Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNMT1P26358 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNMT1P26358 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms