Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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