Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMNB1P20700 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms