Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CXCL3P19876 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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