Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATF3P18847 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATF3P18847 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATF3P18847 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATF3P18847 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms