Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGAM1P18669 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms