Protein–RNA interactions for Protein: P18507

GABRG2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG2P18507 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRG2P18507 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms