Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS1P17812 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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