Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EPCAMP16422 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms