Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ITGA4P13612 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms