Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODC1P11926 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms