Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DMDP11532 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DMDP11532 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DMDP11532 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms