Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HKR1P10072 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HKR1P10072 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HKR1P10072 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms