Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM225BP0DP42 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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