Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms