Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms