Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOP08100 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHOP08100 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOP08100 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms