Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
IGKV4-1P06312 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms