Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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