Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGFRP00533 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGFRP00533 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGFRP00533 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms