Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1AO95602 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms