Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTNSO60931 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTNSO60931 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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