Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLOCKO15516 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLOCKO15516 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLOCKO15516 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms