Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARPC5O15511 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARPC5O15511 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms