Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RGPD3A6NKT7 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms