Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MTMR11A4FU01 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms