Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA6A0AVT1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA6A0AVT1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA6A0AVT1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms