Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP3K4Q9Y6R4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K4Q9Y6R4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms