Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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