Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED16Q9Y2X0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms