Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms