Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CGGBP1Q9UFW8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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