Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC4Q9UBN4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms