Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms