Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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COMMD9Q9P000 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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COMMD9Q9P000 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COMMD9Q9P000 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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